La tercera década del rock nacional no comenzó muy bien a nivel institucional. Cuando Alfonsín llegó al gobierno varios grupos rockeros fueron invitados a participar de recitales al aire libre en parques públicos por la Secretaria de cultura de la municipalidad.Todo cambió cuando asumió Felix Luna y suspendió esa serie de conciertos veraniegos, por considerar que "podrían provocar violencia".
1987 sería el año de cosecha de Soda, que provoca furor en varios países latinoamericanos y tras sus pasos estaban Los Enanitos Verdes. Fito Páez comienza a recuperarse de las desgracias familiares con Ciudad de pobres corazones. Pappo vuelve a armar Riff y una banda prometedora inicia su camino por el sendero del éxito son Los Ratones Paranoicos.
Una de las pérdidas más notorias del Rock nacional fue, en Diciembre de 1987. la de Luca Prodan, quien no podía controlar su adicción por el alcohol, así es como moría el hombre y nacía la leyenda.
Cuando el rock no había asimilado la perdida de Luca, también moría Miguel Abuelo. Sólo, con pocos amigos y sin dinero, dejaba el mundo en marzo de 1988.
Sumo se dividió en dos grupos: Divididos y Las Pelotas.
Rata Blanca comenzó a imponerse como una banda de "metal clásico", tomando influencias de Deep Purple. 1988 terminó con otra muerte: Federico Moura, que tomó al público de Virus con la guardia baja.
En 1989, mientras tanto, Andrés Calamaro, junto con Ariel Roth y sus demás integrantes conforman Los Rodriguez. Rata Blanca dio una gran sorpresa con sus millones de discos vendidos. Charly compone Filosofía barata y zapatos de goma en el que incluye su versión del Himno Nacional. La Portuaria grabó cuatro álbumes.
Para comienzos de los ‘90 grupos como Patricio Rey y sus Redonditos de Ricota, La Renga, Divididos y Los Piojos han logrado superar hace tiempo sus limitaciones y se han convertido en grupos muy influyentes en el rock argentino moderno, y populares a nivel internacional. Las mejores bandas del género también cuentan con una inusual versatilidad para coquetear con distintos géneros como el tango, el folk, la música latina y el jazz, entre otros.
En abril de 2000, Patricio Rey y sus Redonditos de Ricota realizaron dos recitales en el estadio de River Plate. La asistencia al evento, más de setenta mil espectadores cada noche, lo convirtió en uno de los shows pagos más exitosos de Argentina y marcó la cima de su celebridad. Sin embargo, en el 2002, tras prolongadas especulaciones sobre el futuro de la banda, se oficializó la separación de la banda con la presentación del primer trabajo como solista del guitarrista Skay Beilinson, A través del mar de los sargazos.
Un estilo que logró cierto espacio fue el rock sónico, influenciado por bandas de los ‘80 como Virus y Soda Stereo. Algunas bandas del movimiento eran Babasónicos y Juana La Loca. En la escena alternativa tomaba auge Catupecu Machu.
En 2004 ocurrió la mayor tragedia del rock nacional desde sus inicios: La noche del 30 de diciembre de 2004, el boliche bailable República Cromañón se incendió como consecuencia de una bengala, mientras tocaba la banda de rock suburbana Callejeros. El incendio del boliche Cromañón fue una gran desventura del rock nacional en sus más de 40 años, ya que dejó un saldo de casi 200 muertos.
En 2005 murió otro de los próceres del rock nacional: Norberto Napolitano, "El Carpo" o simplemente Pappo, falleció como consecuencia de un accidente de tránsito la madrugada del 25 de febrero en Luján.
Y ya acercándonos a 2010 se podría hablar de una segunda ola de bandas suburbanas, como Los Guasones, Callejeros, La Mancha de Rolando, Los Tipitos y de bandas rolingas, como La 25, Villanos, Jóvenes Pordioseros, y en cierta medida Pier. Almafuerte, se mantiene al frente de la escena metalera, demostrando su convocatoria en los recitales y la única banda de heavy en el mainstream es Rata Blanca.
